在颜色上,叶绿素a呈蓝绿色,而叶绿素b呈黄绿色。叶绿素a的生物合成途径,是由琥珀酰辅酶A和甘氨酸缩合成δ-氨基乙酰丙酸,两个δ-氨基乙酰丙酸缩合成吡咯衍生物胆色素原,然后再由4个胆色素原聚合成一个卟啉环──原卟啉Ⅳ,原卟啉Ⅳ是形成叶绿素和亚铁血红素的共同前体,与亚铁结合就成亚铁血红素,与镁结合就成镁原卟啉。
镁原卟啉再接受一个甲基,经环化后成为具有第Ⅴ环的原脱植醇基叶绿素,后者经光还原、酯化等步骤而形成叶绿素a。叶绿素b是叶绿素的其中一种,常作为光合作用的天线色素吸收光能。叶绿素b比叶绿素a多一个羰基,因此更容易溶于极性溶剂。它的颜色是黄绿色,主要吸收蓝紫光。
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